工藤新一是全国()著名的高()中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一()找到了经常帮助他的()阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止()犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名()，暗中追查他们，希望能()得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠()博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之()下编造了自己名叫江户川柯()南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲()毛利小五郎是一名私家侦()探，新一可以籍着和他一()起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！